张哲（华农教授）

张哲（华农教授）的个人简介

张哲，男，博士，华南农业大学动物科学学院动物遗传育种与繁殖系教授，博士生导师。1984年3月生，籍贯河南。2011年6月中国农业大学动物科技学院动物遗传育种与繁殖专业博士研究生毕业，曾赴英国、德国、荷兰、波兰进行访问学习和学术交流，多次参加国内专业领域学术交流。主讲《生物统计学》、《动物育种学》、《数量遗传学》等本科及研究生课程。主要从事动物育种中基因组选择方法及应用相关教学科研工作。主持国家自然科学基金、教育部博士点基金、广东省自然科学基金等科研项目12项，主要参加国家重点研发、国家自然科学基金、农业部现代农业产业体系等科研项目12项。在Frontiers in Genetics、Journal of Animal Science、PLoS ONE、Journal of Dairy Science、BMC Genetics、 G3、科学通报、遗传等国内外学术期刊发表研究论文70余篇，参编论著2部。

工作经历

2001.9--2005.7中国农业大学，动物科技学院，动物科学专业学习，获农学学士学位

2006.9--2011.6 中国农业大学，动物科技学院，动物遗传育种与繁殖专业硕博连读，获农学博士学位

2009.10--2010.9英国爱丁堡大学（University of Edinburgh），罗斯林研究所（Roslin Institute）访问学习，国家留学基金委（CSC）全额资助公派联合培养博士研究生

2011.7--2012.3 华南农业大学，动物科学学院动物遗传育种系讲师

2012.4--2012.10德国哥廷根大学（Goettingen University），动物科学系动物遗传育种研究组合作研究，欧盟LOTUS II项目全额资助访问学者

2012.11--2014.12 华南农业大学，动物科学学院动物遗传育种系讲师

2015.1--2018.12 华南农业大学，动物科学学院动物遗传育种系副教授，硕士生导师

2019.1--，华南农业大学，动物科学学院动物遗传育种系教授，博士生导师

研究方向

动物遗传育种中基因组选择方法及应用、动物复杂性状遗传解析。

讲授课程

本科生：《家畜育种学》、《生物统计学》

研究生：《数量遗传学》

论文论著

Shaopan Ye, Ning Gao, Rongrong Zheng, Zitao Chen, Jinyan Teng, Xiaolong Yuan, Hao Zhang, Zanmou Chen, Xiquan Zhang, Jiaqi Li, andZhe Zhang. Strategies for obtaining and pruning imputed whole-genome sequence data for genomic prediction.Frontiers in Genetics. 2019, 10: 673Zitao Chen; Shaopan Ye; Jinyan Teng; Shuqi Diao; Xiaolong Yuan; Zanmou Chen; Hao Zhang; Jiaqi Li;Zhe Zhang. Genome-wide association studies for the number of animals born alive and dead in Duroc pigs.Theriogenology. 2019, 139:36-42Xiaolong Yuan, Shaopan Ye, Zitao Chen, Xiangchun Pan, Shuwen Huang, Zhonghui Li, Yuyi Zhong, Ning Gao, Hao Zhang, Jiaqi Li,Zhe Zhang. Dynamic DNA Methylation of ovaries during pubertal transition in gilts.BMC Genomics. 2019, 20:510Shaopan Ye, Xiaolong Yuan, Shuwen Huang, Hao Zhang, Zanmou Chen, Jiaqi Li, Xiquan Zhang,Zhe Zhang. Comparison of genotype imputation strategies using a combined reference panel for chicken population.Animal. 2019, 13（6）:1119-1126Shuqi Diao, Shuwen Huang, Zitao Chen, Jinyan Teng, Yunlong Ma, Xiaolong Yuan, Zanmou Chen, Hao Zhang, Jiaqi Li,Zhe Zhang. Genome-wide selective signature detection in three south China indigenous pigs.Genes. 2019, 10（5）:346Jinyan Teng*, Ning Gao*, Haibin Zhang, Xiujin Li, Jiaqi Li, Hao Zhang, Xiquan Zhang,Zhe Zhang. Performance of whole genome prediction for growth traits in a crossbred chicken population.Poultry Science. 2019, 98（5）:1968-1975Xiaolong Yuan, Zhonghui Li, Shaopan Ye, Zitao Chen, Shuwen Huang, Yuyi Zhong, Hao Zhang, Jiaqi Li, andZhe Zhang. Genome-wide DNA methylation analysis of pituitaries during the initiation of puberty in gilts.PLoS ONE. 2019, 14（3）:e0212630Jiaying Wang, Shuwen Huang, Shaopan Ye, Xiquan Zhang, Hao Zhang, Jiaqi Li, Xiquan Zhang,Zhe Zhang. Genome wide association study on feed conversion ratio using imputed sequence data in chickens.Asian-Australasian Journal of Animal Science. 2019, 32（4）:494-500Ning Gao, Jinyan Teng, Shaopan Ye, Shuwen Huang, Xiaolong Yuan, Hao Zhang, Xiquan Zhang, Jiaqi Li,Zhe Zhang. Genomic prediction of complex phenotypes using genic similarity based relatedness matrix.Frontiers in Genetics. 2018, 9:364Jiabo Wang*, Zhengkui Zhou*,Zhe Zhang*, Hui Li, Di Liu, Qin Zhang, Peter Bradbury, Edward Buckler, Zhiwu Zhang. Expanding BLUP Alphabet for Genomic Prediction Adaptable to the Genetic Architectures of Complex Traits.Heredity. 2018, 121: 648-662Shuwen Huang, Yingting He, Shaopan Ye, Jiaying Wang, Xiaolong Yuan, Hao Zhang, Jiaqi Li, Xiquan Zhang,Zhe Zhang. Genome-wide association study on chicken carcass traits using sequencing data imputed from SNP array.Journal of Applied Genetics. 2018, 59（3）:335-344Shaopan Ye*, Xiaolong Yuan*, Xiran Lin, Ning Gao, Yuanyu Luo, Zanmou Chen, Jiaqi Li, Xiquan Zhang,Zhe Zhang. Imputation from SNP chip to sequence: a case study in a Chinese indigenous chicken population.Journal of Animal Science and Biotechnology. 2018, 9:30Zhe Zhang, Zhenqiang Xu, Yuanyu Luo, Haibin Zhang, Ning Gao, Jinlong He, Congliang Ji, Dexiang Zhang, Jiaqi Li, Xiquan Zhang. Whole genomic prediction of growth and carcass traits in a Chinese quality chicken population.Journal of Animal Science. 2017, 95（1）:72-80Ning Gao, Jiaqi Li, Jinlong He, Guang Xiao, Yuanyu Luo, Hao Zhang, Zanmou Chen,Zhe Zhang. Improving Accuracy of Genomic Prediction by Genetic Architecture Based Priors in a Bayesian Model.BMC Genetics. 2015, 16:120Zhe Zhang, Malena Erbe, Jinlong He, Ulrike Ober, Ning Gao, Hao Zhang, Henner Simianer, Jiaqi Li. Accuracy of whole genome prediction using a genetic architecture enhanced variance-covariance matrix.G3-Genes Genomes Genetics. 2015, 5（4）:615-627Zhe Zhang, Xiujin Li, Xiangdong Ding, Jiaqi Li, Qin Zhang. GPOPSIM: a Simulation Tool for Whole-Genome Genetic Data.BMC Genetics. 2015, 16:10.Zhe Zhang, Jinlong He, Hao Zhang, Ping Gao, Malena Erbe, Henner Simianer, Jiaqi Li. Results of Genome Wide Association Studies Improving the Accuracy of Genomic Selection.The Proceedings of the 10th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production（WCGALP） 695. 2014, in Vancouver, CanadaZhe Zhang, Ulrike Ober, Malena Erbe, Hao Zhang, Ning Gao, Jinlong He, Jiaqi Li, Henner Simianer. Improving the Accuracy of Whole Genome Prediction for Complex Traits Using the Results of Genome Wide Association Studies.PLoS ONE. 2014, 9（3）: e93017Xiangdong Ding*,Zhe Zhang*, Xiujin Li*, Xiaoping Wu, Dongxiao Sun, Ying Yu, Jianfeng Liu, Qin Zhang. Accuracy of genomic prediction for milk production traits in the Chinese Holstein population using a reference population consisting of cows.Journal of Dairy Science. 2013, 96（8）: 5315-5323Zhe Zhang, Qin Zhang, Xiangdong Ding. Advances in genomic selection in domestic animals.Chinese Science Bulletin. 2011,56（25）:2655-2663Zhe Zhang, Xiangdong Ding, Jianfeng Liu, Qin Zhang, Dirk-Jan de Koning. Accuracy of genomic prediction using low density marker panels.Journal of Dairy Science, 2011, 94（7）:3642-3650Zhe Zhang, Xiangdong Ding, Jianfeng Liu, Dirk-Jan de Koning, Qin Zhang. Genomic selection for QTL-MAS data using a trait-specific relationship matrix.BMC Proceedings. 2011, 5（S3）:15Zhe Zhang, Jianfeng Liu, Xiangdong Ding, Piter Bijma, Dirk-Jan de Koning, Qin Zhang. Best linear unbiased prediction of genomic breeding values using a trait-specific marker-derived relationship matrix.PLoS ONE. 2010, 5（9）:e12648Zhe Zhang, Xiangdong Ding, Jianfe1ng Liu, Dirk-Jan de Koning, Qin Zhang. TA-BLUP: a new genetic evaluation method for genomic selection.The proceedings of the 9th world congress on genetics applied to livestock production （WCGALP）. 2010, in Leipzig, Germany张哲，张豪，陈赞谋，李加琪. 种猪育种性能测定校正公式研究. 中国畜牧杂志, 2015, 51（16）:49-54张哲, 罗元宇, 李晴晴, 贺金龙, 高宁, 张豪, 丁向东, 张勤, 李加琪. 一种基于高密度遗传标记的亲子鉴定方法及其应用. 遗传, 2014, 36（8）: 835-841张哲, 贺金龙, 邓熙, 高宁, 吴海娥, 张豪, 李加琪. 杜洛克猪生长性状全基因组关联分析. 广东农业科学, 2014, （14）:139-143张哲, 吴龙,陈赞谋,刘敬顺,李娅兰,王青来,吴珍芳, 张豪. 长白母猪妊娠天数影响因素及效应分析. 安徽农业科学, 2014, 42（13）:3920-3922张哲, 张勤, 丁向东. 畜禽基因组选择研究进展. 科学通报, 2011, 56（26）: 2212-2222张哲, 张勤. 混合家系随机抽样群体期望亲缘系数的计算. 中国农业大学学报, 2008, 13（1）: 42-46张哲, 王楚端. 计算机视觉技术在猪眼肌肌内脂肪含量测定中的应用. 猪业科学, 2006, 23（2）: 24-25

科研项目

基于序列并整合生物学先验的全基因组预测新方法研究，国家自然科学基金面上项目，2018.1至2021.12，主持人优质肉鸡全基因组选择育种技术研究，广东省科技厅，2016.1至2017.12，主持人“广东特支计划”科技青年拔尖人才，广东省科技厅，30万元，2015.4至2018.3，主持人基于畜禽基因组序列数据的基因组选择遗传评定方法研究，广东省自然科学基金面上项目，2014.10至2017.10 1，主持人基于组学信息的畜禽基因组遗传评定方法研究，广州市科信局珠江科技新星专项，2015.1至2017.12，主持人利用畜禽全基因组SNP芯片的多性状基因组选择方法研究，国家自然科学基金青年基金，2013.1至2015.12，主持人畜禽多性状全基因组选择方法模拟研究，教育部博士点基金博士启动项目，2013.1至2015.12，主持人基于猪高密度SNP芯片的全基因组选择遗传评估方法研究，广东省自然科学基金博士启动，2012.10至2014.10，主持人猪重要经济性状全基因组选择方法研究，华南农业大学校长基金，2012.1至2013.12，主持人华南地区地方猪种质资源调查，科技部科技基础性工作专项，2014.5至2018.4，参加考虑基因与环境互作的基因组育种值估计新方法，国家自然科学基金面上项目，2014.1至2017.12，参加猪重要经济性状高密度SNP芯片开发及其GS育种技术研究与应用，广东省高等学校科技创新重点项目，2012.1至2014.12，参加母猪卵巢早衰相关miR-148a功能鉴定与分子调控机制研究，国家自然科学基金青年基金，2013.1至2015.12，参加应用全基因组选择培育高产高效瘦肉型猪新品系及产业化示范，广州市科技攻关重大项目，2011.6至2013.12，参加国家现代农业产业技术体系岗位专家项目，农业部现代农业产业技术体系项目，2011.1至2015.12，参加华南农业大学中山生猪农科教基地，教育部农业部农科教人才培养基地项目，2012.1至2014.12，参加

奖励荣誉

2018.10，获广东省农业技术推广二等奖《华南区域地方猪种质资源杂交利用及示范推广》，32018.8，获中国畜牧兽医学会养猪学分会“改革开放40年养猪业创新人才奖”；2017.12，获国家超级计算广州中心“天河之星”优秀应用入围奖；2017.2，获广东省科学技术二等奖《数字化种猪育种关键技术研发与产业化应用》，5；2016.9，获“吴常信动物遗传育种基金”优秀论文奖；2016.9，获华南农业大学“教书育人”先进个人荣誉称号；2016.7，获华南农业大学“优秀共产党员”荣誉称号；2015.12，获华南农业大学“科技新星”荣誉称号；2015.4，获广东特支计划科技创新青年拔尖人才称号；2015.1，获广州市“珠江新星”第五批资助；2013.8，获2013广东省农业技术推广一等奖《现代猪分子育种技术的应用与推广》,8；2012.9，获2011广东省农业技术推广一等奖《华南种猪遗传评估系统建立及应用》,13；2012.1，参与项目《中国荷斯坦牛基因组选择技术平台的建立》通过教育部科技成果鉴定，9；