1972年10月，学校前身广州军区生产建设兵团子弟中学创建。
1975年，更名为海南农垦中学，隶属广东省农垦总局。
1985年，学校被海南省农垦总局审定为首批示范学校。
1988年，海南建省，更名为海南省农垦中学。
2004年6月，学校被海南省农垦总局确定为“海南省农垦一级学校”。
2007年11月，学校被海南省农垦总局授予“海南省农垦普通高中一级学校”。
2014年，学校由海南省农垦总局正式移交给海南省教育厅管辖。[1]
2017年6月，学校被授予“省一级（甲等）学校”。
教育教学硬件设施校内设有各类教室100多间。所有教室实现多媒体上课，免费联入100兆光纤高速宽带互联网。学校为每位教师配备了时新笔记本电脑一台，与学科网、英才苑合作共享教学资源，另建垦中教学网支持常规教学和数字化管理。[2]
校内建了有初中综合教学楼、学生食堂、学生宿舍、篮球场、综合体育馆（羽毛球、乒乓球）；400米标准环形跑道足球场，羽毛球场、监控室、录播室、理化生实验室、计算机教室、多媒体教学设备；每间教室配备有计算机、投影仪、电子白板等现代化教学设备；综合阅览室、班级阅览室、电子阅览室（与海大图书馆联网）、音乐室高、初中部各1间，形体室、美术室、报告厅，演播厅等；学校还建有专门的校园网和OA办公系统。
据2021年1月学校官网显示，学校占地面积为162亩，建筑面积88641平方米。学校有各类教室100多间，面积约5000平方米，所有教室实现多媒体上课，所有办公室、教师宿舍、学生座位都联入宽带互联网。还有学生食堂、学生宿舍、篮球场。
办学规模我校现有初、高中六个年级共68个教学班，其中初中33个班，高中35个班，有在校学生3219人，其中初中学生1598人，高中学生1621人。
据2021年1月学校官网显示，学校占地面积为162亩，建筑面积88641平方米；有65个教学班，其中初中33个班，高中32个班，有在校学生3219人。
此外，学校有联盟学校4所，共建学校5所，共建单位5个，与泰国政府委派的教育机构互派师生，与香港福建中学结成了姊妹学校。
校园景观
师资力量学校现有在职教职工373人，其中正高级职称教师1人，特级教师3人，高级职称教师150人。省级学科工作室首席导师2人，导师10人；海南省中学卓越教师工作室首席导师1人，导师1人。
据2021年1月学校官网显示，学校有专任教师316人，其中正高级职称教师1人，特级教师3人，高级职称教师141人，中级职称教师112人，初级职称教师62人；有省级学科工作室首席导师2人，导师10人；省级卓越学科工作室首席导师1人，导师1人。
省级学科带头人：王英、何文胜、吴春霞
省级骨干教师：刘红禄等
海南省农垦中学
教育成果教师成绩2019年4月，学校教师在海南省参加全国第五届中小学生艺术展演活动中，获二等奖1人；同年5月，学校在海南省教育科学规划课题2019年度集中结题活动中，4项一般课题和1项小课题通过结题评审；6月，学校教师在海南省2019年中小学实验教学说课优秀案例评选中，获奖1人；8月，学校教师在第二十六届全省教师教育教学信息化评比活动中，获一等奖1人、三等奖2人；12月，学校教师在第二十三届全国教师教育教学信息化交流活动中，获二等奖1项。
2020年5月，学校教师在海南省第十四届中学物理青年教师课堂教学大赛中，获一等奖1人、二等奖1人；10月，学校教师在第十四届全国初中英语教师教学基本功大赛暨教学观摩研讨会活动中，获一等奖1人、二等奖5人；同月，学校教师在海南省2020年中学青年数学教师课堂教学评比中，获一等奖1人、二等奖1人。
截至2020年7月，近年来，学校承担了国家级科研课题3个，其中两项海南省高考综合改革重点课题结题并获得省级优秀课题；省级科研课题7个，其中1项获省级优秀课题。发表论文20余篇，出版专集6本。近三年省级论文评比活动中，共有15人获一等奖，27人获二等奖，33人获三等奖。
学生成绩考试成绩高考成绩
2018年高考，学校有800分以上10人、700分以上145人，本科A批上线率97%。
2019年高考，学校本科A批上线率超过97.6%。
2020年高考，学校参考465人，本科上线458人，上线率98.49%；特殊类型招生投档上线420人，占比90.32%。
中考成绩
2017年中考，学校有最高分783分，700分以上109人，占实考人数的20.1%；全年级前20名人均分756. 5分、前50名人均分743.78分、前100名人均分728.5分、前200名人均分703.5分。
比赛成绩2018年5月，学校学生在海南省第二十一届中学生（初中）理科实验操作竞赛中，获一等奖2人；6月，学校学生在海南省第九届中小学生艺术展演活动中，获一等奖4人、三等奖2人；8月，学校学生在海南省第九届中小学生艺术展演活动中，获一等奖5项、二等奖1项；9月，学校学生在“我的海洋梦想”海南省中小学生绘画大赛活动中，获一等奖2人、二等奖1人、三等奖2人、优秀奖1人；同年12月，学校在第三届全国学生“学宪法 讲宪法”活动中，获全国个人演讲二等奖、知识竞赛团体一等奖1人。
2019年8月，学校学生在2019年海南省中学生美育赛事活动中，获一等奖3人、二等奖4人、三等奖1人；同年11月，学校学生在2019年中华经典诵写讲大赛海南赛区比赛中，获三等奖1项；12月，学校学生在第五届奥秘万千·海南省青少年科普知识大赛中，获冠军1项。
2020年5月，学校学生在第32届海南省青少年科技创新大赛中，获三等奖1人；10月，学校学生在第五届海南省学生（大中小学）“学宪法 讲宪法”省级比赛活动中，获一等奖2人、二等奖2人。
素质成绩体育类
2016年12月，学校在海南省中学生运动会中，获银牌2人、铜牌1人。
2017年4月，学校在2016—2017年度海口市校园足球联赛中，获初中乙组亚军。
2018年11月，学校在2018年海南省中学生运动会田径赛暨体育传统项目学校田径赛中，获第三名1人。。[3]
学科竞赛
2014年，第28届中国化学奥林匹克（初赛）海南赛区比赛：黄大铸同学荣获二等奖；吴晓林同学荣获三等奖。第31届全国中学生物理竞赛（海南赛区）比赛：王茂仲等6名同学荣获二等奖；陶启发等7名同学荣获三等奖。2015年政治组获海南省首届模拟联合国大赛最佳组织奖。2015年全国生物学科竞赛（海南赛区）比赛：冯大智、钟林茂等6名同学荣获一等奖；陈亦全、方勇钧等19名同学荣获二等奖；陈震宇、洪世伟等17名同学荣获三等奖；2016年获得一等奖2人并获全国铜牌，二等奖8人，三等奖10人。2015年全国物理学科竞赛（海南赛区）比赛：陈嘉兴、冯大智等7名同学荣获二等奖；谢可桂、王政博等14名同学荣获三等奖。2015年全国数学学科竞赛（海南赛区）比赛：陈亦全、王政博两名同学荣获二等奖；张麒腾、林琨等4名同学荣获三等奖。2015年全国化学学科竞赛（海南赛区）比赛：杨铭洋同学荣获二等奖；洪世伟、杨诚睿等5名同学荣获三等奖。2015信息奥林匹克联赛（海南赛区）比赛：黄鑫、麦舒植等3名同学荣获三等奖。在第九届海南省“科普小先生”演讲比赛中，王泓泓同学荣获高中组一等奖，钟新同学荣获初中组三等奖。英语2016年省级大赛一等奖1人，国家级电视口语比赛二、三等奖各1人。2015-2016信息技术竞赛一等奖1人，二等奖6人，三等奖6人。化学2015-2016年数学组参加省奥赛二等奖6人，三等奖14人。
2016年，我校在数学、物理、生物等学科奥林匹克竞赛中，获奖达到60多人次。其中张则成、唐嘉鑫两位同学获得25届全国中学生生物奥林匹克铜牌，梁昌曜、刘一卓和王世佶共三位同学获得2016年全国数学竞赛一等奖，王政博同学获得第33届全国中学生物理竞赛一等奖（第十名）。
在2016年的第三届海南省青少年航模教育竞赛中，有15人次获奖，其中刘烨同学获得金牌，陈文雅同学获得铜牌。[4]
所获荣誉1985年和1989年两次被农业部评为先进单位。
2003年被教育厅评为“体育先进学校”，被农垦总局评为计生先进单位、社保工作先进单位。
2005年海南省教育厅组织的“双实验教学评估”获得优秀、顺利通过了省“教师继续教育培训”检查和“双基教育”检查。
在海南省农垦2004-2005年度教育教学评估中被评为优秀单位、德育教育先进单位。
2005年被评为海南省实验教学一级学校，4月被总局评为2004年度计划生育优秀单位，5月校团委被总局评为2004年“五四红旗”团委和海南垦区优秀学校、海南垦区中小学德育工作先进集体。
2006年，我校荣获“海南省新课程改革先进集体”称号，在海南省教育厅“现代技术教育学校”和“现代实验学校”评估中获得“优秀”等级。
2015年评为“六五普法”优秀学校称号。
2016年获国家义务教育质量监测优秀组织奖。海南省首届中学生游泳邀请赛最佳组织奖。
在农垦总局管辖时期，学校担负着垦区90多个农场员工子女的高中教育和农场中学教师的培训任务，四十多年来向全国大中院校输送优秀毕业生50000余人，培养了4名省高考状元，诞生了3个世界体育冠军。[5]
截至2020年7月，学校先后获得全国青少年足球特色学校、海南省新课程改革先进集体、海南省美育学校、海南省优秀文化传承校、海南省德育教育先进单位、共青团海南省五四红旗团委等称号。
学校文化学校标识校徽学校徽志呈圆型，底色为黄色，上方为“农垦中学”第一个拼音字母变形组合成一只飞翔的大鹏图案，下方为波浪型海水纹。图案取意庄子《逍遥游》，寓意为“南海之鹏”。
教室一角
校旗学校校旗分为主旗和副旗。主旗为“垦中蓝”海蓝色长方形旗帜，副旗为红色长方形旗帜，中央均印有学校徽志、中方题写的校名以及学校英文大写的标准组合。校歌《奔向辉煌》。
词：李天明 曲：李天明
牢记父母的嘱托，向往美好的明天。我们是绚丽的花朵，我们是初生的太阳。啊～垦中，我为你歌唱！好好学习，自尊自爱，以苦为舟，我们扬帆扬帆学海，扬帆学海！封闭式管理，开放式教学，立体化育人，我们步伐坚定；与时俱进，开拓进取，师生携手，共创辉煌！
肩负民族的重任，怀着伟大的理想，我们是奋进的一代，我们是未来的主人。啊～垦中，我为你自豪！天天向上，自强自立，雄鹰展翅。我们翱翔翱翔蓝天，翱翔蓝天！封闭式管理，开放式教学，立体化育人，我们步伐坚定。与时俱进，开拓进取。师生携手，共创辉煌！
理念：为全面发展的人奠基，为幸福的人生着色。[6]
特色：开放式教学，数字化管理，立体化育人。
学校标识
校徽学校校徽以黄色为主色调，图案以红色和蓝色表示。红色图案为我们展示了一个小鸟，鸟的翅膀上的字母“NKZX”与小鸟融为一体；蓝色图案表现了蓝色的大海。
精神文化
校训自信、自律、自主、自由[7]
教育的根本任务是立德树人。自信、自律，是“树人”的基础。这是基于中国传统文化中人与天地万物“天人合德”的关系而确立的两个精神要素。结合现代教育理念，我们增加了“自主、自由”两个关键词。自由是一种做人、做事的最高境界，是“全面发展的人”升华到“随心所欲不逾矩”的简洁描述。
校风勤勉、坚韧、乐观、进取
教风修身、敬业、长善、救失
学风博学、约取、切问、精思
学生活动
社团组织截至2019年1月，学校有音乐社、模拟联合国社团、古风社等19个社团。
日常活动据2021年1月学校官网显示，学校举办社团文化节、元旦游园活动、漫画形象设计大赛、水果拼盘创意大赛、校园歌手比赛、手抄报比赛等社团活动。
除此之外，学校还举办年级楼层文化、教室门牌专栏文化、宿舍管理文化、食堂超市文化等，校园涂鸦、美食活动、毕业感恩教育、入学军政训练、国旗下讲话、学生报刊及十多个校级主题活动。还有每学期各2次的中学生心理辅导。
