1978年11月—1983年12月，就读于江西中医学院，获得学士学位；
1984年9月—1987年7月，就读于中国中医科学院，获得硕士学位；
1994年9月—1997年7月，就读于中国中医科学院，获得博士学位。
工作经历1983年12月—1984年9月 在江西景德镇959医院工作；
1987年7月—1999年10月 在中国中医科学院基础理论研究所工作，1992年、1997年分别晋升为副研究员、研究员；
1999年10月—2002年 10月 任中国中医科学院基础理论研究所所长；
2002年10月—2006年12月 任江西本草天工科技有限责任公司董事长；
2003年起 跟随国医大师朱良春老师学习；
2006年5月起 任中国中医科学院临床所常务副所长、首席研究员；
2008年起 任广东中医药科学院副院长、首席研究员；
2012年2月起 任香港浸会大学中医学院院长、首席教授。
研究方向中医药的标准化研究。长期致力于中医药防治自身免疫性疾病机制研究和疾病证候分类科学基础研究。重点以类风湿性关节炎为研究对象，深入研究了中医证候分类的方法、证候分类的生物学基础、证候分类与药物疗效的关系以及中医药治疗类风湿性关节炎机理。
学术兼职中国中西医结合学会副会长，江西药理学会副理事长，中国中西医结合学会外语专业委员会主任委员，北京（国家）蛋白质组学研究中心学术委员会副主任委员，现代中药制剂教育部重点实验室学术委员会常务副主任委员，《胃肠病学世界周刊》、《中医杂志》、《中医药杂志》、《中医结合医学杂志》编辑部成员等。
科研成果在国际国内主要学术刊物上发表学术论文200余篇；编写专著12部；主持国家自然基金项目6项，国家十一五支撑计划项目1项；参与科技部科技攻关、国家基础性研究工作、973计划和863计划项目多项。
两项突出成果：
1、类风湿性关节炎（RA）中医证候分类科学基础：从中医症状和症状组合的角度，初步阐明了中医药治疗RA疗效与证候分类的关系以及中医证候分类的代谢组学和基因组学基础；同时利用中医证候理论，初步证明了生物医学治疗方案治疗RA的疗效与中医证候分类的关系，并创新发现RA关节损伤与血小板、IgA的关联关系。
2、中医药的黏膜免疫调节途径：从肠道粘膜免疫反应角度，初步阐明了中药复方治疗RA和中药多糖治疗肿瘤的药效机制。
获奖情况1.获得省部级以上奖励10余项；
2.获中药复方、中药新药的剂量以及双向胶囊的开发等领域专利40多项；
3.获“中国杰出科学工作者”等荣誉称号。。
主要论文吕爱平，陈可冀. Improving Clinical Practice Guideline Development in Integration of Traditional Chinese Medicine and Western Medicine[J].Chinese Journal of Integrative Medicine,2015(03).
吕爱平，蔡丹梅. 论中医学中和思维的内涵及特点[J].中国中医基础医学杂志,2012(02).
吕爱平，卞兆祥，陈可冀. Bridging the Traditional Chinese Medicine Pattern Classification and Biomedical Disease Diagnosis with Systems Biology[J].Chinese Journal of Integrative Medicine,2012(12).
吕爱平，赵静，姜淼. 中医证候分类和复杂干预措施是影响中医临床疗效评价的核心问题[J].中国中西医结合杂志,2011(04) .
吕爱平，陈可冀. Chinese Medicine Pattern Diagnosis Could Lead to Innovation in Medical Sciences[J].Chinese Journal of Integrative Medicine,2011(11).
吕爱平. 重视类风湿关节炎治疗的中医证候分类研究[J].中国中西医结合杂志,2007(07).
吕爱平. 类风湿性关节炎中医证候分类的系统生物学基础[J].世界科学技术-中医药现代化,2007(01).
吕爱平，赵静，姜淼. 完善中医临床经验总结方法，促进中医理论现代化[J].中国中医基础医学杂志,2007(11).
吕爱平，何羿婷，查青林，闫小萍，苏励，宋跃进，曾升平，刘维，冯兴华，钱先，朱婉华. 类风湿性关节炎症状与疗效关系的回归分析[J].中西医结合学报,2005(06).
吕爱平，李梢，王永炎. 从主观症状的客观规律探索中医证候分类的科学基础[J].中医杂志,2005(01).
吕爱平，吴萍，鞠大宏，贾宏伟，李梢，徐世杰，赵宁，肖诚，吴皓，滕静茹，李艳，王少君，周桂琴，张浩，王安民. 用胶原诱导性关节炎探讨中药治疗类风湿性关节炎的方法学研究[J].中国中药杂志,2004(06).
吕爱平，陈明人，简晖，徐世杰，肖诚. 中药现代化研究应重视与中医现代化研究的结合[J].中国中医药信息杂志,2003(08).
吕爱平，鞠大宏，左铮云，马超英. 中医基础理论学科建设初探[J].中国中医基础医学杂志,2003(02).
吕爱平，梅智胜，吴萍，徐世杰，贾红伟，李艳，滕静如，王少君，王安民. Ⅱ型胶原免疫诱导动物关节炎痹证动物的体液免疫特征[J].中国中医药信息杂志,2000(09).
吕爱平. 关节软骨免疫与类风湿性关节炎——Ⅱ型胶原所致免疫性关节炎发病机制[J].中国中医基础医学杂志,2000(05).
吕爱平，徐世杰，刘振丽，王安民. 关节免疫损伤动物模型——Ⅱ型胶原所致关节炎研究进展[J].中国中医基础医学杂志,1996(01).
吕爱平，刘振丽，张枢明，王安民. 宣发膜原法对免疫性关节炎(痹证)小鼠免疫功能的影响[J].中国中西医结合杂志,1997(11).
吕爱平. 骨骼肌横小管DHP受体研究概况[J].国外医学(生理、病理科学与临床分册),1994(02).
吕爱平，艾景录. 论证候规范化与中医现代化[J].医学与哲学,1993(10).
吕爱平，王安民. 对中医“证”实验研究的反思[J].医学与哲学,1987(10).
吕爱平，王安民，曾晓莲. 益肾蠲痹丸对大鼠实验性痹证影响的病理学研究[J].中医杂志,1988(06).
出版著作1.类风湿性关节炎的中医药学--药用植物学研究的新动态丛书 Advances in Botanical Research Volume: 62 Pages: 273-313 2012
2.健康中国2020—中医药部分人物 中国人口健康出版社
3.中医药上市后理论与实践评价 中国人口健康出版社 副主编 2012年
4.中医药创新方法学研究系列丛书（8本）中国科技出版社 主编 2012年
5.雷公藤治疗类风湿性关节炎的利益 类风湿性关节炎章节 2010年
6.中医循证临床实践指南--专科疾病 中国中医药出版社 副主编之一 2010年
7.中医循证临床实践指南--中医内科 中国中医药出版社 副主编之一 2010年
8.中医循证临床实践指南--针灸 中国中医药出版社 副主编之一 2010年
9.中药上市后临床再评价关键技术 人民卫生出版社 主编之一 2010年
10.中医药现代化发展战略研究 人民卫生出版社 编委 2009年
11.大黄现代研究 北京大学医学出版社 副主编之一 2008年
12.中西医结合研究思路与方法学 上海科技出版社 主编之一2007年
