内在因素
1、数量稀少，难以大量繁殖。
2、繁殖率低，生长较慢。
人为因素
1、人类对其食物鱼虾进行过度捕捞，致使白鱀豚得不到充足的食物供给。
2、人类对长江的过度开发，使白鱀豚的栖息地遭到严重干扰和破坏。
3、人类在长江附近建造的化工厂和医药厂，使长江水质受到严重污染。
4、长江成为了非常繁忙的运输水道，很多白鱀豚被船只的螺旋桨打死打伤。
由于人类活动增加或活动不当，使白鱀豚意外死亡事故增多。据统计，1973—1985年间，共意外死亡59头，其中被鱼用滚钩或其它渔具致死29头，占48.8%。
被江中爆破作业致死11头，占18.6%被轮船螺旋桨击毙12头，占20%搁浅死亡6头，占10%误进水闸1头，占1.6%。另据统计，长江下游水域中意外死亡的白鱀豚，有三分之一是被轮船螺旋桨击毙的。
