中国科学院兰州冰川冻土研究所
1958年6月，中国科学院高山冰雪利用研究队在原中国科学院青甘综合科学考察队之冰川小分队的基础上成立（是中国科学院兰州冰川冻土研究所的前身），大本营设在兰州。
1962年中国科学院高山冰雪利用研究队调整为中国科学院地理研究所冰川冻土研究室。
1965年与中国科学院地理研究所沙漠研究室（原治沙队）合并成立了中国科学院兰州冰川冻土沙漠研究所。
1978年以冰川冻土研究领域为主成立了中国科学院兰州冰川冻土研究所。
中国科学院兰州高原大气物理研究所
1958年10月在兰州建立了中国科学院地球物理研究所兰州地球物理研究室，领导进行人工降水、人工消雹和融冰化雪等试验研究，并负责管理兰州观象台业务。
1959年5月正式成立了中国科学院地球物理研究所兰州分所（是中国科学院兰州高原大气物理研究所的前身），主要开展青藏高原气象学、高原和干旱气候、辐射气候、边界层物理、云和降水物理、大气电学以及大气环境监测评价等领域的研究。
1974年4月1日正式组建了中国科学院兰州高原大气物理研究所。
中国科学院兰州沙漠研究所
1958年10月，国家有关部门在内蒙古呼和浩特市召开了内蒙古、新疆、甘肃、青海、陕西、宁夏六省（区）治沙规划会议。
1959年3月在兰州成立了中国科学院治理沙漠科学考察队（简称“治沙队”，是中国科学院兰州沙漠研究所的前身），并分别成立了10个考察队，当年就开始了北方地区的沙漠、戈壁和沙地的综合考察。
1962年中国科学院治理沙漠科学考察队调整为中国科学院地理研究所沙漠研究室。
1965年整体从北京迁至兰州，与中国科学院地理研究所冰川冻土研究室合并成立了中国科学院兰州冰川冻土沙漠研究所。
1978年以沙漠研究领域为主成立了中国科学院兰州沙漠研究所。
合并发展1999年6月，在中国科学院原兰州冰川冻土研究所、兰州高原大气物理研究所、兰州沙漠研究所的基础上整合后设立中国科学院寒区旱区环境与工程研究所。
2000年，由原中科院冰川所、沙漠所、大气所图书馆合并组建而成的中国科学院寒区旱区环境与工程研究所图书馆正式成立。
2012年10月26日至28日，中国科学院寒区旱区环境与工程研究所和中国科学院青藏高原研究所主办，中国科学院寒旱区陆面过程与气候变化重点实验室承办的“西北干旱区和青藏高原大气边界层国际研讨会”在兰州举办。
五所整合2016年6月24日，中国科学院西北生态环境资源研究院（筹）在兰州宣布成立。西北研究院实行院长负责制，整合了寒区旱区环境与工程研究所、兰州油气资源研究中心、兰州文献情报中心以及西北高原生物研究所、青海盐湖研究所，形成了一院两地五单元的科研格局。
科研条件人员编制截至2013年底，中国科学院寒区旱区环境与工程研究所共有在职职工645人，其中，中国科学院院士3人，科研人员347人，科技支撑人员160人，正高级技术人员93人，副高级技术人员146人，进创新岗位人员473人，国家“百千万人才”工程入选者7人，中国科学院“百人计划”入选者34人，国家“杰出青年科学基金”获得者14人，国家“西部之光人才计划”入选者81人。
中国科学院院士：
程国栋、秦大河、赖远明（全兼职）中国科学院"百人计划"入选者安黎哲陈国雄董治宝冯起高艳红何元庆何志斌侯书贵黄春林金会军赖远明李锋瑞李宁马小飞齐吉琳拓万全王宁练王若愚王新平温智中国科学院寒区旱区环境与工程研究所
2014年3月，中国科学院寒区旱区环境与工程研究所已形成七大研究室、三大研究系统的庞大科研及支撑体系，突出了冰川、沙漠、高寒区资源生态环境与可持续发展研究特色。七大研究室分别是：冰冻圈与全球变化研究室，沙漠与沙漠化研究室，高原大气物理研究室，冻土与寒区工程研究室，寒旱区水土资源研究室，生态与农业研究室，遥感与地理信息研究室。三大研究系统分别是以实验分析研究为主的实验分析系统，以野外观测试验研究为主的试验观测系统，以信息共享和网络应用、图书编辑服务为主的信息平台系统。为使科研与支撑体系融合成为有机整体，实验室和野外台站均归入到相应研究室。
国家重点实验室：
冻土工程国家重点实验室、冰冻圈科学国家重点实验室中国科学院寒区旱区环境与工程研究所
中国科学院重点实验室：
寒旱区陆面过程与气候变化重点实验室、内陆河流域生态水文实验室、沙漠与沙漠化重点实验室、中科院寒旱所遥感与地理信息科学研究室、内陆河流域生态水文实验室甘肃省省级重点实验室：
甘肃省极端环境微生物资源与工程重点实验室、内陆河流域生态水文实验室、寒旱所遥感与地理信息科学研究室、甘肃省黑河生态水文与流域科学重点实验室设备资源设施设备
中国科学院寒区旱区环境与工程研究所
根据2015年12月研究所官网显示，中国科学院寒区旱区环境与工程研究所的仪器设备分被应用于研究所环境演变监测平台、环境演变分析平台、工程方法研发平台、逆境生态研究平台、计算模拟平台五大平台。有以下在用大型仪器设备。此外设有便携设备调度中心。环境演变监测平台：
三维地貌激光扫描系统、多相流力学实验测量系统环境演变分析平台：
离子色谱仪系统、离子色谱仪ICS-3000型、气体同位素比质谱仪MAT-253、气体同位素比质谱仪MAT-252、离子阱气质联用仪、X射线荧光光谱仪、释光全自动测量仪、室内风沙环境风洞、气体稳定同位素质谱仪工程方法研发平台：
多通道探地雷达、地质雷达、AGI多道分布式密度电法仪器、振动三轴材料试验机、振动三轴试验机逆境生态研究平台：
实时荧光定量PCR仪计算模拟平台：
超级计算馆藏资源
中国科学院寒区旱区环境与工程研究所图书馆于2000年由原中科院冰川所、沙漠所、大气所图书馆合并组建而成，该馆是一个小型、专业化图书馆，以地学为主，边缘学科为辅，突出书刊的学术性、理论性，力求书刊的系统性与完整性，寒旱所图书馆馆藏书刊具有鲜明的冰川、冻土、沙漠和大气、水文专业特色。截至2006年11月，有中西文现刊182种、中英文报纸16种：馆藏中西文过刊3万余册，最早可回溯至1929年，中文图书23000余册，英、俄、日文图书22000余册；各类地图十万余幅，航空照片近十万张，水文气象资料近万册。
合作交流2016年3月，中科院寒旱区陆面过程与气候变化重点实验室（简称陆-气实验室）与荷兰屯特大学地理信息科学与地球观测学院（简称ITC）、瑞士GAMMA Remote Sensing Research机构和欧洲航空航天局（简称欧空局）在玛曲地区共同开展了微波辐射科学研究试验。
2016年1月17日，塔里木大学水利与建筑工程学院土木工程系主任杨保存一行四人到中国科学院寒区旱区环境与工程研究所交流访问。
科研成就截至2014年底，寒旱所共有在研项目947项，主持国家重点基础研究发展计划（973）项目7项，主持科技部科技支撑计划项目6项；主持国家自然科学基金项目462项，承担国家自然科学基金重大研究计划重点项目8项，承担国际合作项目4项，承担院重点部署项目5项、战略性先导科技专项A类8项，B类2项。新增国家自然科学基金委杰出青年基金获得者1人，国家自然科学基金委优秀青年基金获得者1人。
研究所一面促进科学研究的同时，一面也对学科进行综合集成，促进重大成果的产出。50余年来，已承担国家“973”、“863”、国家攻关、重点基金及国家地方的其他科研项目3000余项。获得国家科技进步特等奖3项、国家科技进步一等奖3项、国家自然科学一等奖1项、国家自然科学、科技进步和技术发明二等奖18项、省部级特等奖4项，一等奖38项、二等奖90余项。
专著
出版时间学科方向著作名称编写人员2012自然地理学《江河源区沙漠化》董治宝2012自然地理学库姆塔格沙漠研究库姆塔格沙漠综合科学考察队2012分子生态学肖洪浪2012地球科学21世纪战略新兴产业-沙产业冯起2012水文学水与区域可持续发展丁永建专利
专利号专利名称:专利类别第一发明人201220061372.1利用薄膜阻止冻土层上水向基坑涌水的结构实用新型俞祁浩201220271237.X水体中溶解碳酸盐中二氧化碳的提取装置实用新型武小波，李全莲，王宁练，蒲建辰201220272259.8一种机械增压水体过滤与化学性质的检测装置实用新型李全莲，武小波，王宁练，蒲建辰201220377469.3翅片加传热片式蒸汽发生器实用新型王士猛，谢爱红，唐柳华201220377735.2翅片式蒸汽发生器实用新型王士猛，谢爱红，唐柳华中国科学院寒区旱区环境与工程研究所是1981年经国务院学位会首批批准的博士、硕士学位授予权单位，1991年设立“地理学”博士后流动站。
一级学科博士点
：地理学一级学科硕士点
：地理学博士后流动站
：地理学教学建设截至2013年底，中国科学院寒区旱区环境与工程研究所共有在读研究生439人，其中，博士生252人、硕士生187人，在站博士后72人。每年招收博士研究生74名，硕士研究生64名。
截至2014年9月，中国科学院寒区旱区环境与工程研究所培养的研究生已有5人获得全国百篇优秀博士论文奖，6人获得中国科学院优秀博士论文奖。
奖助学金分配模式及医疗保险：
中国科学院寒区旱区环境与工程研究所为学生提供良好的奖助学金待遇，硕士研究生人均可获得各类奖助学金合计27200元/人·年，博士研究生人均可获得各类奖助学金合计44600元/人·年。此外，公费办理医疗保险，优秀推免生源第一学年实行特别奖励。
文化标识形象标识形象标识
中国科学院寒区旱区环境与工程研究所形象标识以原兰州冰川冻土研究所、兰州沙漠研究所和兰州高原大气物理研究所的研究方向分别为冰川、沙漠、大气为素材，所徽将三所的研究方向融为一体，设计并勾勒出寒区旱区环境与工程研究所形象标识。文化活动2014年3月7日，寒旱所以“三八”妇女节为契机，举办庆祝“三八”妇女节双扣比赛，以丰富研究所女职工业余文化生活，增进职工间相互了解。
2013年6月，寒旱所离退办分批组织退休、内退人员在芳草园公园进行游园活动，老科学家、老领导、老党员、老工人等近300人参加了本次活动。
2012年12月31日，中国科学院寒区旱区环境与工程研究所研究生2013年元旦联欢会暨第一届“我是好声音”歌手大赛开赛。
