巴黎贝尔西站是一个尽头式的火车站，开口朝西北方向。受地形影响，站台、站房及前面的小广场比相邻的贝尔西大道（Boulevard de Bercy）要高出大约6米，有露天电梯和残疾人电梯与地面相连。相比于其他的六个火车站，巴黎贝尔西站的设施非常简陋，其候车厅面积不超过1000平方米，也没有配套的大型餐饮或购物中心。
本站可直达城市以下城市按照法语名的首字母顺序排列，
加粗字体的城市为省会（Préfecture）
：巴黎贝尔西站的通达度
屈尔河畔阿尔西（Arcy sur Cure）、欧吉（Augy）、欧塞尔（Auxerre）
、博讷（Beaune）、索恩河畔美丽城（Belleville sur Sa?ne）、布里亚尔（Briare）、约讷河畔尚皮尼（Champigny-sur-Yonne）、沙尼（Chagny）、索恩河畔沙隆（Chalon sur Sa?ne）、沙泰勒森苏瓦（Chatel-Censoir）、约讷河畔尚（Champs sur Yonne）、克莱蒙费朗（Clermont-Ferrand）
、卢瓦尔河畔孔讷（Cosne-Cours-sur-Loire）、约讷河畔库朗日（Coulanges-sur-Yonne）、克拉旺（Cravant）、第戎（Dijon）
、弗尔尚博勒（Fourchambault）、日安（Gien）、茹瓦尼（Joigny）、卢瓦尔河畔拉沙利特（La-Charité-sur-Loire）、屈尔河畔吕西（Lucy-sur-Cure）、里昂（Lyon）
、马孔（Macon）
、马伊拉维勒（Mailly-la-Ville）、米热纳（Migennes）、蒙达尔纪（Montargis）、蒙巴尔（Montbard）、穆兰（Moulins）
、内穆尔（Nemours）、讷韦尔（Nevers）
、维尔尼松河畔诺让（Nogent-sur-Vernisson）、籹（Nuits）、约讷河大桥镇（Pont-sur-Yonne）、普格雷若（Pougues-les-Eaux）、里永（Riom）、圣弗洛朗坦（Saint-Florentin）、金山圣日耳曼（Saint-Germain-au-Mont-d'Or）、圣朱利安杜索勒（Saint-Julien-du-Sault）、桑斯（Sens）、赛尔米泽勒（Sermizelles）、同奈尔（Tonnerre）、图尔尼（Tournus）、卢瓦尔河畔特拉西（Tracy sur Loire）、韦纳雷勒洛梅（Venarey les Laumes）、韦隆（Véron）、维希（Vichy）、索恩河畔自由城（Villefranche sur Sa?ne）、吉雅尔新城（Villeneuve-la-Guyard）、约讷河畔新城（Villeneuve-sur-Yonne）、旺塞勒（Vincelles）、武特内（Voutenay）本站出发需中转可到达的主要城市从巴黎贝尔西站可以直达美丽的克莱蒙费朗
在克莱蒙费朗站
（Gare de Clermont-Ferrand），可换乘省内列车（TER）或大巴车，前往欧里亚克
（Aurillac）、布里巫德
（Brioude）、伊苏瓦尔
（Issoire）、朗格尼
（Langogne）、马尔弗约勒
（Marvejols）、芒德
（Mende）、讷萨尔格
（Neussargues-Moissac）、圣弗洛尔
（Saint Flour）、沃勒维克
（Volvic）等地。在
讷韦尔站
（Gare de Nevers），可换乘TER列车，前往德西兹
（Desize）、欧布瓦河畔拉盖尔士
（La Guerche sur l'Aubois）、吕兹
（Luzy）等方向。在
阿瓦隆站
（Gare d'Avallon），可换乘大巴车，前往奥坦
（Autun）、韦兹莱
（Vézelay）等地。列车时刻表注：①“大致运行频率”和“发车时间”指的是每周一至五的运行情况，周末及节假日很多线路可能会调整或停运。②资料截止：2015年7月，本时刻表仅供参考，不排除因施工或其他原因而临时改变列车运行计划，具体情况请在法国国家铁路公司（SNCF）的官方网站上查询。
巴黎贝尔西站（Gare de Paris Bercy）列车时刻表终点站
主要途径城市
车型
大致运行频率
克莱蒙费朗讷韦尔、穆兰、维希、RiomIntercités每天8趟左右讷韦尔蒙达尔纪、Nogent-sur-Vernisson、日安、Cosne、Tracy-Sancerre每天7趟左右里昂PerracheSens、拉米站、蒙巴尔、第戎、博讷、Chagny、索恩河畔沙隆、Tournus、马孔、Belleville sur Sa?ne、Villefranche sur Sa?neTER15:38里昂帕丢站每天5趟左右自2013年起，法国国家铁路公司（SNCF）开行经济型大巴车（ID Bus）线路，大部分都是从巴黎贝尔西站出发，可前往里尔、里昂以及一些邻国的城市。ID Bus不能在现场购买车票，必须在网上订票。因其运行时刻经常变化，故时刻表在此不再列举。
前往巴黎其他火车站1.
巴黎里昂站
2.巴黎东站
3.巴黎北站
4.
巴黎圣拉扎尔车站
5.巴黎蒙帕纳斯车站
6.巴黎奥斯特里茨车站
7.
马恩河谷
8.戴高乐机场
本站公交线路公交巴黎公交24路
巴黎公交87路
此外，巴黎公交夜间线路（Noctilien）N32、N35、N130路也经过巴黎贝尔西站
地铁巴黎地铁6号线
巴黎地铁14号线
